Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI79

Ccdc40, Coiled-coil domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc40Q8BI79 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc40Q8BI79 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc40Q8BI79 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms