Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aldh3b1Q80VQ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Aldh3b1Q80VQ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Aldh3b1Q80VQ0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms