Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ube3cQ80U95 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ube3cQ80U95 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube3cQ80U95 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube3cQ80U95 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms