Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpv1Q704Y3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpv1Q704Y3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpv1Q704Y3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpv1Q704Y3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms