Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
March6Q6ZQ89 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
March6Q6ZQ89 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
March6Q6ZQ89 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms