Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd300lfQ6SJQ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300lfQ6SJQ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300lfQ6SJQ7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms