Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NfrkbQ6PIJ4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NfrkbQ6PIJ4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms