Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm4Q6IRU2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm4Q6IRU2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpm4Q6IRU2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms