Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpcQ62241 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms