Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Foxd1Q61345 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Foxd1Q61345 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Foxd1Q61345 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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