Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf235Q61116 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf235Q61116 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf235Q61116 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf235Q61116 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms