Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cnot7Q60809 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnot7Q60809 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnot7Q60809 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms