Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CoblQ5NBX1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CoblQ5NBX1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CoblQ5NBX1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms