Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prune2Q52KR3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prune2Q52KR3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prune2Q52KR3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms