Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdgfl1Q2VPR5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdgfl1Q2VPR5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms