Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdx4Q07424 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdx4Q07424 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdx4Q07424 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms