Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Siah1bQ06985 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Siah1bQ06985 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Siah1bQ06985 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Siah1bQ06985 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms