Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GscQ02591 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GscQ02591 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GscQ02591 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GscQ02591 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GscQ02591 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GscQ02591 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GscQ02591 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GscQ02591 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GscQ02591 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GscQ02591 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GscQ02591 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GscQ02591 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GscQ02591 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GscQ02591 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GscQ02591 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GscQ02591 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GscQ02591 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GscQ02591 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GscQ02591 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GscQ02591 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GscQ02591 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GscQ02591 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GscQ02591 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GscQ02591 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GscQ02591 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GscQ02591 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GscQ02591 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GscQ02591 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GscQ02591 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GscQ02591 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GscQ02591 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GscQ02591 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GscQ02591 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GscQ02591 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GscQ02591 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GscQ02591 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GscQ02591 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GscQ02591 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GscQ02591 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GscQ02591 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GscQ02591 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GscQ02591 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GscQ02591 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GscQ02591 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GscQ02591 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GscQ02591 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GscQ02591 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GscQ02591 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GscQ02591 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GscQ02591 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GscQ02591 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GscQ02591 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GscQ02591 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GscQ02591 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GscQ02591 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GscQ02591 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GscQ02591 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GscQ02591 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GscQ02591 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GscQ02591 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GscQ02591 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GscQ02591 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GscQ02591 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GscQ02591 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GscQ02591 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GscQ02591 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GscQ02591 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GscQ02591 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GscQ02591 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GscQ02591 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GscQ02591 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GscQ02591 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GscQ02591 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GscQ02591 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GscQ02591 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GscQ02591 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GscQ02591 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GscQ02591 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GscQ02591 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GscQ02591 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GscQ02591 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GscQ02591 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GscQ02591 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GscQ02591 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GscQ02591 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GscQ02591 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GscQ02591 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GscQ02591 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GscQ02591 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GscQ02591 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GscQ02591 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GscQ02591 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GscQ02591 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GscQ02591 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GscQ02591 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GscQ02591 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GscQ02591 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GscQ02591 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GscQ02591 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms