Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ufd1P70362 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufd1P70362 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufd1P70362 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms