Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Traf5P70191 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Traf5P70191 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf5P70191 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf5P70191 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Traf5P70191 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf5P70191 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf5P70191 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf5P70191 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Traf5P70191 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf5P70191 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf5P70191 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf5P70191 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf5P70191 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf5P70191 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf5P70191 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Traf5P70191 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf5P70191 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf5P70191 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf5P70191 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms