Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl39P62892 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39P62892 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms