Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpaP58389 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpaP58389 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtpaP58389 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtpaP58389 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtpaP58389 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpaP58389 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpaP58389 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpaP58389 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpaP58389 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpaP58389 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpaP58389 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpaP58389 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpaP58389 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms