Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fdft1P53798 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fdft1P53798 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fdft1P53798 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fdft1P53798 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fdft1P53798 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fdft1P53798 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fdft1P53798 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fdft1P53798 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fdft1P53798 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fdft1P53798 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fdft1P53798 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fdft1P53798 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fdft1P53798 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fdft1P53798 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fdft1P53798 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fdft1P53798 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fdft1P53798 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fdft1P53798 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fdft1P53798 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fdft1P53798 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fdft1P53798 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fdft1P53798 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fdft1P53798 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fdft1P53798 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fdft1P53798 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fdft1P53798 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fdft1P53798 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fdft1P53798 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fdft1P53798 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fdft1P53798 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fdft1P53798 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fdft1P53798 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fdft1P53798 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fdft1P53798 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fdft1P53798 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fdft1P53798 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fdft1P53798 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fdft1P53798 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fdft1P53798 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fdft1P53798 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fdft1P53798 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fdft1P53798 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fdft1P53798 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fdft1P53798 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fdft1P53798 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fdft1P53798 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms