Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CitP49025 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CitP49025 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CitP49025 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CitP49025 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CitP49025 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CitP49025 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CitP49025 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CitP49025 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CitP49025 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CitP49025 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CitP49025 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CitP49025 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CitP49025 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CitP49025 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CitP49025 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CitP49025 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CitP49025 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CitP49025 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CitP49025 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CitP49025 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CitP49025 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CitP49025 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CitP49025 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CitP49025 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CitP49025 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CitP49025 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CitP49025 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CitP49025 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CitP49025 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CitP49025 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CitP49025 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CitP49025 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CitP49025 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CitP49025 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CitP49025 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CitP49025 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CitP49025 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CitP49025 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CitP49025 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CitP49025 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CitP49025 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CitP49025 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CitP49025 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CitP49025 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CitP49025 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CitP49025 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CitP49025 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CitP49025 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CitP49025 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CitP49025 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CitP49025 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CitP49025 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CitP49025 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CitP49025 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CitP49025 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CitP49025 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CitP49025 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CitP49025 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CitP49025 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CitP49025 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CitP49025 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CitP49025 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CitP49025 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CitP49025 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CitP49025 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CitP49025 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CitP49025 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CitP49025 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CitP49025 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CitP49025 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CitP49025 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CitP49025 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CitP49025 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CitP49025 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CitP49025 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CitP49025 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CitP49025 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CitP49025 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CitP49025 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CitP49025 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CitP49025 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CitP49025 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CitP49025 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CitP49025 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CitP49025 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CitP49025 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CitP49025 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CitP49025 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CitP49025 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CitP49025 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CitP49025 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CitP49025 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CitP49025 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CitP49025 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CitP49025 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CitP49025 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CitP49025 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CitP49025 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CitP49025 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms