Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpargP37238 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpargP37238 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpargP37238 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpargP37238 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpargP37238 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpargP37238 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpargP37238 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpargP37238 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpargP37238 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpargP37238 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpargP37238 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpargP37238 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpargP37238 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpargP37238 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpargP37238 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpargP37238 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpargP37238 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpargP37238 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpargP37238 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpargP37238 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpargP37238 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpargP37238 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PpargP37238 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PpargP37238 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PpargP37238 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PpargP37238 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PpargP37238 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PpargP37238 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PpargP37238 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PpargP37238 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PpargP37238 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PpargP37238 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PpargP37238 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PpargP37238 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PpargP37238 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PpargP37238 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PpargP37238 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PpargP37238 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PpargP37238 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpargP37238 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpargP37238 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpargP37238 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpargP37238 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpargP37238 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpargP37238 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpargP37238 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpargP37238 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpargP37238 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpargP37238 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PpargP37238 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PpargP37238 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PpargP37238 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PpargP37238 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PpargP37238 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PpargP37238 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PpargP37238 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PpargP37238 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PpargP37238 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PpargP37238 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PpargP37238 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PpargP37238 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PpargP37238 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpargP37238 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PpargP37238 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpargP37238 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpargP37238 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpargP37238 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpargP37238 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpargP37238 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpargP37238 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PpargP37238 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PpargP37238 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PpargP37238 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PpargP37238 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PpargP37238 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PpargP37238 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PpargP37238 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PpargP37238 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PpargP37238 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PpargP37238 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PpargP37238 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PpargP37238 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PpargP37238 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PpargP37238 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PpargP37238 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PpargP37238 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PpargP37238 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PpargP37238 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PpargP37238 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PpargP37238 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PpargP37238 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PpargP37238 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpargP37238 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpargP37238 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpargP37238 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpargP37238 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpargP37238 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpargP37238 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PpargP37238 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms