Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aco1P28271 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aco1P28271 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aco1P28271 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aco1P28271 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aco1P28271 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aco1P28271 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aco1P28271 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aco1P28271 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aco1P28271 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Aco1P28271 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aco1P28271 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aco1P28271 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Aco1P28271 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Aco1P28271 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Aco1P28271 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Aco1P28271 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms