Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PcnaP17918 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PcnaP17918 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PcnaP17918 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PcnaP17918 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PcnaP17918 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PcnaP17918 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PcnaP17918 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PcnaP17918 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PcnaP17918 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PcnaP17918 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms