Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nr4a1P12813 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nr4a1P12813 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms