Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl1P10146 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl1P10146 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl1P10146 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms