Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rdh16O54909 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh16O54909 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms