Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim18J3QNP2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim18J3QNP2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms