Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r176G3UW31 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r176G3UW31 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r176G3UW31 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r176G3UW31 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms