Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd1E9Q3H4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms