Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms