Protein–RNA interactions for Protein: D3YUJ3

Ccnyl1, Cyclin Y-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnyl1D3YUJ3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccnyl1D3YUJ3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccnyl1D3YUJ3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms