Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samt1A2BED8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samt1A2BED8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samt1A2BED8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms