Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin3aA2AIR5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin3aA2AIR5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3aA2AIR5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms