Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl2A2AGA4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhbdl2A2AGA4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhbdl2A2AGA4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhbdl2A2AGA4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rhbdl2A2AGA4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhbdl2A2AGA4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhbdl2A2AGA4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhbdl2A2AGA4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhbdl2A2AGA4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhbdl2A2AGA4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhbdl2A2AGA4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhbdl2A2AGA4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rhbdl2A2AGA4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rhbdl2A2AGA4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rhbdl2A2AGA4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhbdl2A2AGA4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms