Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm26623-201ENSMUST00000180911 850 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm7609-203ENSMUST00000160058 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm45217-201ENSMUST00000206576 1026 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms