Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms