Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
D17h6s53eQ9Z1R4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms