Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh11Q9QYF1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms