Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tomm40Q9QYA2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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