Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VapbQ9QY76 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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