Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdcQ9QW08 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdcQ9QW08 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms