Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3bQ9ES34 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms