Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pop5Q9DB28 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms