Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms