Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms