Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rep15Q9D7T1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rep15Q9D7T1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms